Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RxrgP28705 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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