Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Apex1P28352 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Apex1P28352 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms