Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gjb1P28230 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gjb1P28230 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms