Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gjc1P28229 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gjc1P28229 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms