Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vav1P27870 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms