Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PdgfraP26618 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms