Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
U2af2P26369 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms