Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Lmo2P25801 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms