Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
NdnP25233 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
NdnP25233 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms