Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hoxd12P23812 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hoxd12P23812 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms