Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tsta3P23591 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tsta3P23591 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms