Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RarbP22605 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RarbP22605 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RarbP22605 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
RarbP22605 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RarbP22605 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms