Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tap1P21958 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms