Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lmnb2P21619 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lmnb2P21619 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms