Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a2P20490 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ms4a2P20490 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms