Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
TP20293 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TP20293 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TP20293 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TP20293 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
TP20293 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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TP20293 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TP20293 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TP20293 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TP20293 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TP20293 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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TP20293 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TP20293 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TP20293 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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TP20293 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TP20293 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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