Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NelfeP19426 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms