Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NefhP19246 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NefhP19246 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NefhP19246 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NefhP19246 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms