Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rps6ka3P18654 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms