Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
P18532 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
P18532 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
P18532 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18532 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18532 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
P18532 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms