Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
P18529 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
P18529 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18529 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18529 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
P18529 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18529 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18529 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18529 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms