Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cxcl9P18340 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms