Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtpraP18052 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtpraP18052 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtpraP18052 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms