Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PcnaP17918 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms