Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Irf1P15314 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms