Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scg5P12961 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms