Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Krt8P11679 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt8P11679 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt8P11679 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms