Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Fv4P11370 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms