Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lire1P11260 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lire1P11260 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lire1P11260 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lire1P11260 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms