Protein–RNA interactions for Protein: P10889

Cxcl2, C-X-C motif chemokine 2, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl2P10889 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cxcl2P10889 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Cxcl2P10889 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cxcl2P10889 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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