Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ccl2P10148 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms