Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LtaP09225 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LtaP09225 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LtaP09225 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LtaP09225 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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LtaP09225 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
LtaP09225 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms