Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Col4a2P08122 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col4a2P08122 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms