Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Egr1P08046 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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