Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprcP06800 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PtprcP06800 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprcP06800 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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PtprcP06800 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PtprcP06800 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PtprcP06800 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PtprcP06800 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PtprcP06800 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PtprcP06800 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms