Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
JunP05627 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
JunP05627 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JunP05627 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JunP05627 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JunP05627 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms