Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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PdgfrbP05622 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PdgfrbP05622 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PdgfrbP05622 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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