Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04213 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P04213 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P04213 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P04213 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P04213 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms