Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
P04212 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
P04212 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
P04212 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
P04212 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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