Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tk1P04184 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tk1P04184 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms