Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lamc1P02468 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lamc1P02468 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms