Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01656 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01656 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01656 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01656 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01656 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01656 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms