Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01654 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01654 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01654 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01654 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01654 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01654 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms