Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifnb1P01575 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms