Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sp1O89090 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sp1O89090 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms