Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Hcn2O88703 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hcn2O88703 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms