Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BlmO88700 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BlmO88700 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BlmO88700 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BlmO88700 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BlmO88700 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BlmO88700 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BlmO88700 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BlmO88700 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BlmO88700 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BlmO88700 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BlmO88700 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms