Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Dnmt3aO88508 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms