Protein–RNA interactions for Protein: O88454

Kcnk4, Potassium channel subfamily K member 4, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk4O88454 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcnk4O88454 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms