Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms